从花上区别：石榴为雌雄花同株不同花植物，雄花呈三角状，而雌花下部膨大明显呈小葫芦形。花石榴的花多为复瓣，而且雌花少而雄花多。而果石榴的花单瓣者多，也有个别品种为复瓣者（如泰山大花石榴），雌雄花数基本相等。

从果上区别：花石榴以观花为主，也有观果者，只是果实小而食用性差，花呈圆筒形，多不结实。而果石榴果实大而汁多，口感好。石榴树上的花是典型的杂生花，既有雄花（钟状花）和两性花（葫芦状和中间类型）。雄花不能结果，两性花容易结果，是结果主力。花石榴和果石榴都具备这样的花型！按照花期看，花石榴的的开花期明显比果石榴长得多！花石榴一般在5~11月开花，一般边开花边结果。果实成熟的时候还有一些花存在。果石榴的花期在5~7月。